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药明康德AI · AI for Science

小核酸药物研发生物信息工程师

上海 社招 · 全职 生物类 研究 / 科学

职位描述

职位描述: 1. 生物信息数据分析: 负责小核酸药物的序列设计和高通量二代测序数据的分析和解读,包括数据预处理、质量控制、比对分析、差异表达分析、信号通路整个分析流程,挖掘与药物研发相关的生物学信息,并及时生成客户报告。快速阅读团队现有Python、R以及Bash脚本并成功运行。 运用生物信息学工具和算法,对生物样本的基因变异、表达谱、剪接异型变化等情况进行深入分析,为药物靶点的发现和验证提供数据支持。 2. 小核酸药物研发支持: 熟悉小核酸(siRNA/ASO等)药物的研发流程, 熟悉小核酸药物序列设计,懂得如何调整序列比对程序参数以适应短序列匹配的需求。 快速阅读团队现有Python、R以及Bash脚本并成功运行。脱靶评估原理和算法, 能够对已有设计/脱靶评估体系进行优化。生成相应报告并与客户沟通。 3. mRNA序列设计: 进行mRNA密码子优化,优化核糖体负载、UTR元件以增加蛋白表达及mRNA稳定性。生成相应报告并与客户沟通。快速阅读团队现有Python、R以及Bash脚本并成功运行。 3. 数据挖掘与知识整合: 调用公共数据库(如NCBI、Ensembl、UniProt等)中的生物信息资源,结合公司内部数据,构建药物研发相关的知识库和数据库。 4. 技术开发与优化: 根据项目需求,开发和优化生物信息分析流程和工具,提高数据分析的效率和准确性。 跟踪生物信息学领域的最新技术进展,引入先进的分析方法和工具,提升团队的技术水平。 5. 跨部门协作与沟通: 与药物研发团队、临床研究团队、生物实验团队等密切合作,及时反馈生物信息分析结果,为项目的整体推进提供支持。 参与项目讨论和决策,从生物信息学角度提供专业意见和建议。

任职要求

1. 教育背景: 博士学位,生物信息学、计算生物学、分子生物学、遗传学、计算机科学、CADD等相关专业。 2. 专业技能: 熟练掌握生物信息学分析工具和软件,如BLAST、Bowtie、SAMtools、DESeq2、Cufflinks、STAR等,能够独立完成高通量测序数据的分析。 熟悉生物信息学数据库(如NCBI、Ensembl、UniProt等)的使用和数据挖掘方法。 具备良好的编程能力,熟练掌握Python或者R编程语言,能够开发和优化生物信息分析流程。熟悉Linux系统。 拥有良好代码编写习惯,懂得如何进行版本控制及避免错误。 加分项:了解机器学习、人工智能等技术在生物信息学中的应用,有相关项目经验者优先。 加分项:懂得运用云计算进行生物信息分析。 加分项:CADD相关软件和技能,例如RDkit,Schrodinger等 加分项:多组学分析经验和技能。 加分项:Perl、C++等其它编程技能 3. 工作经验: 具有>5年以上生物信息分析工作经验或小核酸药物研发项目经验 4. 其他要求: 具备良好的沟通能力和团队合作精神,能够与不同背景的团队成员有效协作。 具有较强的学习能力和问题解决能力,能够快速掌握新知识和新技术。 对药物研发领域有浓厚兴趣,能够承受一定的工作压力。 良好的英文书写和沟通能力,能够使用英语和中文为工作语言。
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